Gli organi della Fondazione, indicati all'articolo 6, sono:
L'organo sicuramente più cruciale per la garanzia della qualità delle iniziative di FIRA è il Comitato Scientifico.
Secondo l'articolo 9 dello statuto, "è composto da 7 membri eletti dal Consiglio di Amministrazione FIRA tra i soci ordinari della Società Italiana di Reumatologia (SIR).
In seno al comitato viene eletto il suo Coordinatore"